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園藝院丨侯喜林教授和劉同坤教授課題組揭示不結(jié)球白菜根系發(fā)育新機(jī)制

2025/01/03 來(lái)源:園藝學(xué)院 作者:侯喜林

近日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)侯喜林教授和劉同坤教授團(tuán)隊(duì)在Horticulture Research在線發(fā)表了題為BcWRKY25-BcWRKY33A-BcLRP1/BcCOW1 module promotes root development for improved salt tolerance in Bok Choy的研究論文,揭示了BcWRKY33A通過(guò)調(diào)控BcLRP1和BcCOW1的表達(dá),促進(jìn)不結(jié)球白菜主根伸長(zhǎng)和根毛形成的作用機(jī)制,提出了BcWRKY25作為鹽脅迫響應(yīng)因子,直接調(diào)控BcWRKY33A在鹽脅迫條件下表達(dá)的工作模式。

根是植物的地下部分,主要負(fù)責(zé)穩(wěn)定和支撐植物地上部分的發(fā)育,儲(chǔ)存和運(yùn)輸水分和養(yǎng)分,并與土壤中的生物相互作用,保證植物的生存和健康。課題組前期研究表明,在鹽脅迫下,不結(jié)球白菜根系中BcWRKY33A表達(dá)顯著上調(diào),異源表達(dá)BcWRKY33A有助于提高擬南芥的耐鹽性和促進(jìn)根系發(fā)育。然而,BcWRKY33A如何調(diào)控根系發(fā)育的詳細(xì)分子機(jī)制尚不明確。

該研究通過(guò)發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因體系獲得轉(zhuǎn)基因株系,發(fā)現(xiàn)相比于35S:GFP植株,35S:BcWRKY33A-GFP根系中的側(cè)根原基發(fā)育速度更快,根尖分生組織區(qū)域細(xì)胞更大,根毛的密度更高;通過(guò)病毒誘導(dǎo)基因沉默(VIGS)技術(shù)獲得BcWRKY33A的沉默株系,與pTRV2根系相比,pTY-BcWRKY33A根系較短,側(cè)根較少,根毛表現(xiàn)出明顯的生長(zhǎng)抑制,表現(xiàn)出卷曲或分叉的表型等。

1 BcWRKY33A過(guò)表達(dá)促進(jìn)不結(jié)球白菜根系伸長(zhǎng)和根毛形成


通過(guò)DNA親和純化測(cè)序(DAP-seq)技術(shù)對(duì)BcWRKY33A下游結(jié)合基因進(jìn)行預(yù)測(cè),并通過(guò)酵母單雜點(diǎn)對(duì)點(diǎn)驗(yàn)證、雙熒光素酶、EMSA等實(shí)驗(yàn)證明了BcWRKY33A可以直接結(jié)合BcLRP1和BcCOW1的啟動(dòng)子,從而調(diào)控其表達(dá)。進(jìn)一步分析了BcLRP1和BcCOW1的表達(dá)模式和生物學(xué)功能,與35S:GFP根系相比,35S:BcLRP1-GFP根系的主根明顯更長(zhǎng),側(cè)根明顯更短,側(cè)根發(fā)育相關(guān)基因BcIAA18、BcIAA28、BcARF7和BcARF19的表達(dá)受到抑制,表明BcLRP1在白菜根中的過(guò)表達(dá)可以增加主根長(zhǎng)度,同時(shí)抑制側(cè)根的形成。同時(shí),與35S:GFP根系相比,35S:BcCOW1-GFP根系的根毛豐度更高,根毛發(fā)育相關(guān)基因BcSCN1、BcTIP1、BcGTL1的表達(dá)顯著上調(diào),表明BcCOW1在白菜根中的過(guò)表達(dá)可以促進(jìn)根毛發(fā)育。

除此之外,探究了BcWRKY33A上游潛在的調(diào)控因子。研究以BcWRKY33A啟動(dòng)子為誘餌進(jìn)行了酵母單雜文庫(kù)篩選,發(fā)現(xiàn)3個(gè)蛋白(BraC03g016460.1、BraC03g045330.1和BraC03g041750.1)參與鹽脅迫響應(yīng)。利用酵母單雜點(diǎn)對(duì)點(diǎn)和雙熒光素酶試驗(yàn)證實(shí)了BraC03g045330.1(BcWRKY25)結(jié)合BcWRKY33A啟動(dòng)子,且BcWRKY25的表達(dá)受到鹽脅迫誘導(dǎo),隨處理時(shí)間延長(zhǎng),表達(dá)量顯著上調(diào),提示其在鹽脅迫響應(yīng)途徑中的重要作用。

綜上,這些結(jié)果有助于闡明BcWRKY25-BcWRKY33A-BcLRP1/BcCOW1模塊在調(diào)控根系發(fā)育方面的作用機(jī)制,增進(jìn)對(duì)植物耐鹽機(jī)制的理解,為提高不結(jié)球白菜的耐鹽性提出潛在的策略。

2 BcWRKY33A介導(dǎo)的不結(jié)球白菜根系發(fā)育的工作模型


南京農(nóng)業(yè)大學(xué)畢業(yè)博士生王惠玉(現(xiàn)就職于北京農(nóng)學(xué)院)為本文的第一作者,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院白菜系統(tǒng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室侯喜林教授和劉同坤教授為該論文的通訊作者。美國(guó)北卡羅來(lái)納州立大學(xué)劉武生教授、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院李英教授、肖棟博士和鄭禹杉、王美云等研究生也參與了本項(xiàng)工作。該研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金(32372698, 32072575)、國(guó)家大宗蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-23-A16)、江蘇省研究生科研與實(shí)踐創(chuàng)新項(xiàng)目(KYCX22_0752)、美國(guó)農(nóng)業(yè)部國(guó)家糧食與農(nóng)業(yè)研究所(NIFA) Hatch project等項(xiàng)目資助。



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